Na fase 3 o projeto dará continuidade aos estudos biológicos, por meio de levantamentos em campo, avançando e aprofundando na investigação sobre os requerimentos de habitat do pato-mergulhão e a identificação de áreas prioritárias para conservação, a partir da ocorrência da espécie, com a indicação dos principais pontos de potencial conflito e o fornecimento de diretrizes para sua conservação e manejo. Essas informações serão repassadas a tomadores de decisão fornecendo subsídios para a conservação da espécie.