O Instituto Terra Brasilis procura desenvolver seus trabalhos em parceria com outras instituições interessadas no tema, seja direta ou indiretamente. Tais parcerias podem se dar através de cooperação técnica, troca de informações ou experiências, desenvolvimento de atividades conjuntas com objetivo comum, financiamentos, apoios, entre outras. Neste sentido, o Terra Brasilis estabelece parceria com instituições governamentais, organizações não-governamentais e com o setor privado, nacionais ou internacionais.

Desde sua fundação o Terra Brasilis formou parceria com as seguintes instituições (em ordem alfabética):

Associação Brasileira de Produtores de Carvão de Eucalipto para Uso Doméstico (ABPED)
Associação Comunitária de Galheiros
BirdLife International / Save Brasil
Central Mãos de Minas
Centro de Capacitação e Apoio ao Empreendedor (ICCAPE)
Conservação Internacional (CI-Brasil)
Conservation des Espèces et des Populations Animales (CEPA)
Consórcio da Usina Hidrelétrica de Aimorés - Vale e CEMIG
Consórcio da Usina Hidrelétrica de Igarapava (CEMIG, CVRD, AngloGold, CSN e CMM)
Ducks Unlimited (DU)
Empresa de Assistência Técnica e Extensão Rural de Minas Gerais (EMATER-MG)
Fundação Banco do Brasil
Fundação Biodiversitas
Fundação O Boticário para a Conservação da Natureza  
Fundação Serra do Cipó
Fundação Zoo-botânica de Belo Horizonte (FZB-BH) 
Fundo Mundial para o Meio Ambiente (GEF)
Fundo Nacional do Meio Ambiente (FNMA)
Gerdau Açominas S/A
GTZ / PRORENDA Rural
Instituto Brasileiro do Meio Ambiente e dos Recursos Naturais Renováveis (IBAMA) 
Instituto Chico Mendes de Proteção à Biodiversidade (ICMBio)
Instituto de Gestão das Águas de Minas Gerais (IGAM)
Instituto Estadual de Florestas de Minas Gerais (IEF-MG)
Ministério do Meio Ambiente (MMA) 
Oregon State University
Prefeitura Municipal de Tiradentes / Empresa Brasileira de Turismo (EMBRATUR)
Prefeitura Municipal de São Roque de Minas
Programa de Pequenos Projetos (PPP)
Rufford Maurice Laing Foundation
Serviço de Apoio às Micro e Pequenas Empresas (Sebrae) - Sebrae Nacional / Sebrae-MG / Sebrae-MA
Universidade Federal de Minas Gerais (UFMG)
US Fish and Wildlife Service (USFWS)
União Mundial para a Natureza (UICN)
Zoologische Gesellschaft für Arten-und Populationsschutz e.V. (ZGAP)
Wildfowl and Wetlands Trust (WWT)